Фамилия Лушутина — женская форма фамилии Лушутин, и её разбор стоит начать с суффикса. В отличие от более распространённых -ов/-ев или -ин, суффикс -ин здесь указывает на принадлежность: «чей сын?» — Лушутин, то есть сын Луши. В русской ономастике такая модель типична для прозвищ, оканчивающихся на -а/-я, и реже встречается у фамилий, образованных от полных имён. Это сразу настраивает на поиск неканонического, народного имени или прозвища в основе.

Основа фамилии — Лушута. Это имя или прозвище, которое, скорее всего, восходит к глаголу «лушить» — в диалектах русского языка он означал «очищать от скорлупы», «шелушить» (орехи, семечки). В переносном смысле так могли назвать человека, который постоянно что-то чистит, лущит, или, иронично, того, кто «обдирает» — вымогателя или хитрого торговца. Менее вероятна, но возможна связь с «луша» — в некоторых говорах так называли рыбу (например, мелкую плотву), что могло стать прозвищем рыбака или любителя рыбы.

Географически фамилия Лушутин (и Лушутина) тяготеет к северным и центральным областям России, особенно к Архангельской, Вологодской и Костромской губерниям. Там фиксировались крестьяне и посадские люди с этой фамилией в переписных книгах XVII–XVIII веков. Встречается она и в Белозерском крае, что подтверждает её исконно русское, недворянское происхождение — предки Лушутиных были, скорее всего, крестьянами или ремесленниками, чьё прозвище закрепилось в документе.

Стоит обратить внимание на редкость фамилии. В отличие от однокоренных Лушин или Лушев, которые образованы от тех же корней, Лушутин сохранил уменьшительный суффикс -ут- (как в именах Петрута, Ванюта). Это делает фамилию более архаичной и локальной: она не «размножилась» через переселения, а осталась в тех местах, где прозвище Лушута было в ходу. Сегодня носительница фамилии Лушутина может с большой вероятностью найти своих однофамильцев в Вологодской или Архангельской области — именно там корни этой фамилии уходят глубже всего.