Фамилия Лякуткина — женская форма фамилии Лякуткин. В основе лежит прозвище или нецерковное имя Лякутка. Слово «лякутка» в русских говорах имеет несколько значений, и разобраться в них — ключ к происхождению.

Наиболее вероятная версия связывает Лякутку с диалектным глаголом «лякать» — пугать, стращать, или «лякнуться» — испугаться. В таком случае Лякуткой могли прозвать пугливого, боязливого человека. Эта модель образования прозвищ по характеру очень распространена: Боязлив, Страшков, Трепетов.

Менее распространённая, но возможная версия — от «лякуша» (лягушка) в некоторых южнорусских говорах. Тогда прозвище могло относиться к человеку с большим ртом или к тому, кто живёт у болота. Однако суффикс -утк- в слове «лякутка» скорее указывает на уменьшительно-ласкательную или пренебрежительную форму от «ляка» (испуг), а не на лягушку.

Суффикс -ин в фамилии Лякуткин указывает на принадлежность: «чей сын?» — Лякуткин, то есть сын Лякутки. Такие фамилии типичны для северных и центральных областей России и часто образовывались от прозвищ, оканчивающихся на -а, -я.

Фамилия редкая, в дореволюционных метрических книгах встречается в основном на северо-востоке Европейской России — в Вятской и Пермской губерниях. Это косвенно подтверждает первую версию: в вятских говорах слово «лякать» в значении «пугать» фиксируется надёжно.

Сословного барьера фамилия не имела: Лякуткины могли быть и крестьянами, и мещанами. Никаких дворянских родов с такой фамилией не известно.