Фамилия Лякуткин — редкая, и её происхождение не лежит на поверхности. Скорее всего, в её основе лежит не имя, а прозвище, и ключ к разгадке — в суффиксе -утк-, который в русских фамилиях встречается нечасто.

Самый логичный путь объяснения — от слова «лякутка». В русских говорах так называли небольшую лягушку (уменьшительное от «лягушка» через форму «лякуша»). Прозвище Лякутка могли дать человеку за какие-то внешние черты (например, за широкий рот или большую гортань) или за манеру поведения — скажем, за привычку громко квакать голосом или прыгать на одной ноге. Фамилии, образованные от названий животных, — один из древнейших пластов русской ономастики, и Лякуткин стоит в одном ряду с Жабиным, Лягушкиным или Квакиным.

Есть и вторая версия, менее очевидная. Суффикс -утк- мог возникнуть из диалектного варианта слова «лядка» (ляжка, бедро). В этом случае Лякуткой называли человека с крепкими ногами или хромого. Однако эта версия слабее, так как слово «лякутка» в значении «лягушка» зафиксировано в словаре Даля, что даёт ей весомое преимущество.

Модель образования проста: прозвище Лякутка → притяжательное прилагательное с суффиксом -ин («чей сын?» — Лякуткин). Это характерно для фамилий, закрепившихся в северных и центральных губерниях России. В южных и западных регионах на месте -ин чаще появлялся суффикс -енко или -ук.

Географически фамилия тяготеет к Вологодской и Архангельской областям. Именно там, в болотистой местности, слово «лякутка» было в ходу, а суффикс -ин — типичным для местного фамильного строя. Носители фамилии, скорее всего, происходят из крестьянской среды: прозвища, данные по природным объектам или животным, редко давали дворянам.

В написании фамилии возможна путаница. Встречается вариант «Лякудкин» (с оглушением т перед к в произношении), но это искажение, а не самостоятельная форма. Корень «лякут-» в обоих случаях один.