Фамилия Лятт — редкая и неочевидная для русского уха. Её происхождение, скорее всего, связано с эстонским языком, и у этой основы есть несколько версий. Самая прямая: прозвище Лятт восходит к эстонскому läti — «латышский», «латвийский». Так могли прозвать человека родом из Латвии или Литвы либо того, кто часто бывал в этих краях по торговым делам. Другая версия отталкивается от эстонского läte — «исток», «источник». Тогда прозвище могло указывать на место жительства, например, рядом с родником или ручьём. Не исключено, что в основе лежит и древнее эстонское личное имя.

Подтверждение эстонским корням находим в документах начала XX века. В Новгородской области упоминается Лятт Александр Иванович, живший на хуторе Чернецово. В Мурманской области, в Кировском районе, родился в 1912 году Лятт Аральд Александр. А Лятт Ида Ивановна, 1873 года рождения, прямо записана эстонкой. Эти записи показывают, что фамилия бытовала на северо-западе России и в Прибалтике, что делает версию об эстонском происхождении наиболее правдоподобной.

Суффикс фамилии — нулевой, без типичных русских окончаний -ов, -ин или -ский. Это говорит о том, что фамилия закрепилась в форме чистого прозвища, без русификации, что характерно для финно-угорских и прибалтийских фамилий, попавших в русскую среду относительно поздно. В отличие от большинства русских фамилий, которые указывали на отца (Иванов) или ремесло (Кузнецов), Лятт прямо называет человека по его этнической или географической характеристике.