Фамилия Лысенкин — яркий пример того, как отчество, образованное от прозвища, закрепилось в качестве родового имени. Её основа — слово «лысый», а суффикс «-кин» указывает на принадлежность: буквально «чей?» — «Лысенкин», то есть сын, потомок человека по прозвищу Лысенка.

Разберём словообразовательную модель. От прилагательного «лысый» образовали прозвище Лысенка — так в старину могли называть человека с заметной лысиной или просто с коротко стриженой головой. Затем к основе Лысенк- добавили типичный русский патронимический суффикс «-ин». Важно, что суффикс «-кин» здесь не случаен: в русской ономастике он часто присоединялся к основам, оканчивающимся на «-а» или «-я» (сравните: Фомин от Фома, Кузьмин от Кузьма). Прозвище Лысенка дало форму Лысенкин, а не, скажем, Лысенков, что сразу указывает на севернорусское или центральное происхождение фамилии — в южных и западных регионах чаще использовали суффикс «-енко» (Лысенко) или «-ук» (Лысенчук).

По своему значению фамилия относится к группе «говорящих» прозвищных фамилий, которые описывали внешность первого носителя. Прямой аналог — фамилии Лысов, Лысаков, Лысиков. Однако Лысенкин стоит особняком из-за редкого суффикса: он не так распространён, как «-ов» или «-ев», что делает фамилию заметной в документах.

Географически фамилия тяготеет к регионам, где бытовала форма «Лысенка» как прозвище. По данным переписей XIX века, Лысенкины чаще всего встречались в Вологодской, Костромской и Вятской губерниях — в зоне распространения «акающих» говоров и суффикса «-ин». Выходцы из этих мест и разнесли фамилию по стране.

Социальный контекст: носители фамилии почти наверняка происходили из крестьянской или мещанской среды. Прозвище закрепилось за человеком без привязки к сословию, но в дворянской среде такие «простые» прозвищные фамилии встречались редко — там предпочитали более книжные или географические формы. Лысенкины, скорее всего, были государственными или помещичьими крестьянами, которых записывали по отцу.

Версия о происхождении от имени Лыс (сокращение от Владислав или Ярослав) маловероятна: такое имя не зафиксировано в русских святцах и бытовой традиции, а прозвищная основа «лыс-» куда естественнее для описания внешности.