Фамилия Любиков образована по одной из самых распространённых в русской ономастике моделей: от имени или прозвища с помощью суффикса -ов. Этот суффикс указывает на принадлежность: Любиков — буквально «сын Любика». Основа здесь — мирское имя Любик, которое восходит к общеславянскому корню «люб-» со значением «любимый», «милый». В древнерусской традиции такие имена (Любим, Любава, Любик) давали не при крещении, а в быту, часто с пожеланием, чтобы ребёнок рос желанным и всеми любимым.

Интересно, что фамилия Любиков встречается реже, чем однокоренные Любимов или Любавский. Это может говорить о том, что форма Любик была более характерна для определённых говоров или регионов. В документах XVI–XVII веков имя Любик фиксируется в северных и центральных уездах России, например, в переписных книгах Новгорода и Вологды. Потомок человека с таким именем — Любиков — со временем закрепил фамилию за своим родом.

Суффикс -ик в основе (Любик) — уменьшительно-ласкательный, что типично для русских нецерковных имён. Он же встречается в фамилиях Иваников, Петриков, но в паре с корнем «люб-» даёт более редкое сочетание. Таким образом, фамилия Любиков — не просто указание на родство, а сохранившееся в веках ласковое прозвище, которое предки дали своему ребёнку.