Фамилия Любаков образована от личного прозвища или мирского имени Любак. В основе лежит общеславянский корень «люб-» со значением «любить, миловать». На Руси этот корень дал множество имён: Любим, Любша, Любочад, Любомир, Любомудр. Имя Любак, скорее всего, давали долгожданному, любимому ребёнку — так называли, чтобы подчеркнуть родительскую нежность.

По другой версии, Любак — прозвище. Его могли дать человеку, который любил ухаживать за женщинами, «бабнику». В этом случае прозвище образовано от глагола «любить» с помощью суффикса -ак-, который придаёт слову оттенок деятеля или носителя свойства.

Суффикс -ак- указывает на возможное украинское или белорусское происхождение прозвища. Именно в этих землях модель образования прозвищ на -ак была особенно распространена. Сама фамилия Любаков построена по стандартной русской модели: к основе Любак добавили патронимический суффикс -ов, что означает «сын Любака» или «потомок Любака». Таким образом, предок носителей фамилии был человеком, которого в округе звали Любак — либо по имени, либо по поведению.