Фамилия Мадюкова образована от прозвища или имени Мадюк. В основе лежит глагол «мадеть», у которого в русских говорах было два близких, но разных значения: «копаться над чем-то, корпеть» и «киснуть, томиться». Первое значение рисует образ человека усидчивого, старательного, который подолгу возится с делом, не бросает на полпути. Второе — более пассивное, описывающее состояние томления или долгого ожидания.

Скорее всего, прозвище Мадюк дали именно усердному и терпеливому работнику. Такие прозвища, образованные от глаголов через суффикс -юк, характерны для северных и центральных говоров России. Суффикс -юк придаёт слову оттенок просторечности и указывает на носителя действия («тот, кто мадеет»). В этом же ряду стоят прозвища Коптюк (от «коптеть»), Трутюк (от «трудиться»), Визглюк.

Если же исходить из второго значения — «киснуть, томиться», — то имя Мадюк могли дать ребёнку с обережной, охранительной целью. В народной традиции считалось, что имя с «вялым» или «медленным» смыслом отведёт от младенца злых духов и болезни: мол, такой ребёнок никому не нужен и не интересен, а значит, и сглазить его не захотят. Парадоксальным образом родители желали Мадюку счастливой и благополучной судьбы.

Фамилия Мадюкова закрепилась в формах Мадюков / Мадюкова, то есть по стандартной русской модели на -ов. Это означает, что предок носителя фамилии был известен в округе именно как Мадюк — либо по характеру, либо по данному при рождении имени. Фамилия редкая, нечастотная, что говорит о локальном бытовании прозвища в пределах одной или нескольких соседних волостей. В современных справочниках фамилия Мадюков встречается в основном в Вологодской и Архангельской областях — как раз в тех краях, где глагол «мадеть» был в ходу.