Фамилия Магиланина — редкая и необычная для русского уха, и её разбор стоит начать с финальной части. Суффикс «-ина» указывает на принадлежность: в русской модели такие фамилии образуются от основ женского рода или от прозвищ, оканчивающихся на «-а»/«-я». Чаще всего это «матронимические» фамилии — то есть образованные от имени или прозвища матери. Однако в случае с Магиланина не всё так однозначно.

Основа фамилии — «Магилан». Сразу бросается в глаза, что это не типично славянское слово. Наиболее вероятная версия — топонимическая. В Грузии есть город Марнеули, который до 1947 года назывался Сарван, но также известен исторический топоним Магила (или Магилани) — местность в регионе Квемо-Картли. Фамилия могла закрепиться за выходцем из этого села или урочища. В таком случае перед нами пример грузинской фамилии, русифицированной добавлением окончания «-ина» — характерный приём для переселенцев, чьи фамилии адаптировались под русскую грамматику.

Менее вероятная, но возможная версия — прозвищная основа от диалектного слова «магила» (в некоторых говорах — «могила», «холм», «насыпь»). Тогда фамилия могла означать «живущий у могилы» или «могильщик», но с учётом редкости формы «магила» (а не «могила») эта гипотеза слабая. Скорее всего, корень иноязычный.

Социальный контекст: носители фамилии Магиланина в России — это, как правило, потомки переселенцев с Кавказа или Закавказья, которые обрусели и сменили окончание фамилии. Встречается фамилия в основном на юге России и в центральных областях, но крайне редко. В дореволюционных метрических книгах единичные записи по этой фамилии фиксируются в Ставропольской и Кубанской губерниях — регионах, где смешивались русские и кавказские фамильные традиции.

Таким образом, Магиланина — скорее всего, русифицированная грузинская или армянская фамилия по месту происхождения. Ударение, судя по модели, падает на предпоследний слог: Магила́нина.