Фамилия Магиленич — редкий случай, когда географическое происхождение просматривается почти наверняка, а вот с исходным значением возможны варианты. Её суффикс «-ич» (в белорусском и польском вариантах часто «-ич/‑ович») указывает на принадлежность к роду: «сын такого-то» или «потомок». Модель типична для белорусских, западнорусских и польских фамилий, особенно среди шляхты и мещан.

Основа «Магилен» почти наверняка связана с топонимом. На карте Беларуси есть несколько деревень с названием Магильно, Магильна, а также город Могилёв (в старой записи — Магилёв). В основе лежит слово «могила» — курган, насыпь, место захоронения. Фамилия Магиленич, скорее всего, означала «выходец из Магильно» или «тот, кто родом из мест с таким названием». Встречается и вариант написания «Могиленич», что подтверждает связь с «могилой».

Вторая, менее вероятная версия — отчество от прозвища Магила. В старину «могилой» могли назвать человека угрюмого, молчаливого или, наоборот, крупного, «грузного», как насыпь. Однако для прозвища форма с суффиксом «-ич» встречается реже, чем просто Магилов или Магилин. Поэтому топонимическое объяснение надёжнее.

Фамилия распространена в основном в Беларуси и на западе России, встречается у белорусов, поляков и литовцев. В польском языке фамилия могла звучать как Magielicz или Magilenicz. В XIX веке носителей фамилии записывали в Минской, Витебской и Могилёвской губерниях, что косвенно подтверждает её «географическое» происхождение. Среди дворянства эта фамилия не отмечена — скорее всего, предки были крестьянами или мещанами, получившими фамилию по месту жительства при переписях.