Фамилия Магниткин — редкий случай, когда прозвище или ремесло, лёгшее в основу, сохранилось в языке почти без изменений. Её ядро — слово «магнитка». Так в XIX — начале XX века в горнозаводских регионах Урала и Сибири называли не только саму Магнитную гору или будущий Магнитогорск, но и небольшие магнитные рудники, а также людей, работавших с магнитным железняком. Человек мог получить прозвище Магнитка, если добывал руду, возил её или жил при таком руднике. Фамилия образована по типичной русской модели: основа Магнитк(а) + суффикс -ин, указывающий на принадлежность: «сын Магнитки». Важно не путать с фамилией Магнитский — та происходит от места (село Магнитное) и имеет книжный, семинарский суффикс -ский. Магниткин же — народная, «производственная» фамилия. Носители её, скорее всего, происходят из горнозаводских крестьян или мастеровых людей Южного Урала, где добыча магнитного железняка велась ещё с XVIII века. География фамилии сегодня узкая — встречается в основном в Челябинской области и Башкортостане, что косвенно подтверждает связь с магнитогорским регионом. В других областях России она почти не фиксируется, что говорит о локальном происхождении и малой миграции рода.