Фамилия Магнитская — это фонетический вариант более распространённой фамилии Магницкая. Разница в написании объясняется просто: в живой речи и при записи фамилии на слух звук «ц» часто заменялся на «тс» или просто «т», что и закрепилось в документах у части носителей. Оба варианта восходят к одному корню — латинскому прилагательному magnus, то есть «большой, великий». Именно эту основу чаще всего использовали в духовных семинариях и академиях, где давали «говорящие» фамилии. Высокого роста ученика или того, кто отличался успехами, могли записать Магницким — как бы подчеркивая его «величие» в прямом или переносном смысле.

Есть и более конкретная историческая версия, связанная с личностью Леонтия Филипповича Телятина. Этот человек, автор знаменитой «Арифметики», по преданию, получил фамилию Магницкий лично от Петра I в 1700 году. Царь якобы сказал, что «как магнит привлекает железо, так и он привлек к себе математику». Если эта версия верна, то все Магницкие и Магнитские, не связанные с семинарской традицией, могут вести родство от этого конкретного человека или его потомков.

Фамилия Магнитские (и Магницкие) известна и в дворянской среде. Один из родов был официально внесён в Дворянскую родословную книгу Казанской губернии в 1888 году. Это значит, что к концу XIX века часть носителей фамилии уже имела подтверждённое дворянское достоинство, что открывало доступ к определённым привилегиям и службе. Однако не стоит думать, что все Магнитские — дворяне: большинство, скорее всего, происходило из духовного сословия или из крестьян, получивших фамилию при переписях. Точно определить, к какой ветви относитесь именно вы, можно только через архивные поиски по конкретной губернии.