Фамилия Макарышев образована от крестильного мужского имени Макарий (от греческого «макариос» - счастливый). Сама по себе фамилия Макарышев является отчеством второго порядка: Макарышев - сын Макарыша, внук Макара. Суффикс -ыш может указывать на белорусские или украинские корни фамилии.