Фамилия Макацария стоит особняком в русском ономастиконе: её выдает редкий для России суффикс «-ия». Такое окончание указывает на грузинские корни. В грузинском языке фамилии с суффиксом «-ия» (реже «-иа») распространены в основном в Западной Грузии, в частности в Мегрелии и Имеретии. Поэтому носитель фамилии Макацария, скорее всего, потомок выходцев из этих регионов.

Основа фамилии — «Макацар». Это древнегрузинское мужское имя, которое в свою очередь происходит от греческого «Макариос» (Μακάριος), что значит «блаженный», «счастливый». В греческой и христианской традиции это имя носили многие святые, в том числе святой Макарий Великий. На грузинской почве имя трансформировалось в «Макари» или «Макаца», а с добавлением уменьшительного суффикса «-ар» (характерного для мегрельского языка) появилась форма «Макацариа» — «маленький Макарий» или «потомок Макария».

Таким образом, фамилия Макацария — это отчество, образованное от имени предка. Первый носитель фамилии, вероятно, был сыном или внуком человека по имени Макаца (Макарий). В грузинской традиции такие фамилии закреплялись за целым родом, и со временем, при переселении в русскоязычную среду, окончание «-иа» перешло в привычное для русского уха «-ия». Встречается также вариант написания «Макацариа», который ближе к исконной мегрельской форме, но в русских документах преобладает «Макацария».

Сословная принадлежность предков могла быть разной: в Грузии фамилии на «-ия» носили как князья и дворяне, так и крестьяне. Конкретных сведений о знатности рода Макацария нет, но сама фамилия не содержит указания на высокий титул. Скорее всего, это фамилия свободных крестьян или священнослужителей, поскольку имя Макарий часто давали в монашестве и духовенстве. В любом случае, фамилия редкая и компактная: в России она почти не встречается за пределами грузинской диаспоры.