Фамилия Махлушев — редкий случай, когда на первый взгляд очевидная тюркская основа сталкивается с неожиданной русской словообразовательной моделью. Её ядро — личное имя Махлуш, которое в свою очередь восходит к арабскому «махлус» — «очищенный», «освобождённый», «спасённый». В мусульманской среде такое имя давали с пожеланием избавления от бед или как благодарность за рождение ребёнка после долгих лет бесплодия. Но вот суффикс -ев указывает на то, что фамилия оформлялась уже на русской почве — скорее всего, в среде крещёных татар, башкир или народов Кавказа, переходивших в православие. Если бы фамилия осталась в тюркской среде, она звучала бы как Махлушов или, с местным патронимическим показателем, Махлуш-оглы.

Географически фамилия тяготеет к двум регионам: юго-востоку Татарстана и западным районам Башкортостана. Встречается она и в Оренбургской области — зоне активного смешения татарского, башкирского и русского населения в XVIII–XIX веках. Именно там, при переходе из магометанства в православие, представителям рода могли давать фамилию по отцовскому имени, но с русским окончанием -ев. Любопытно, что в некоторых документах XIX века фамилию записывали через «а» — Махлашев, что указывает на акающее произношение, свойственное для части татарских говоров.

Есть и другая, менее вероятная версия: связь с диалектным русским словом «махлуша» — так в некоторых говорах называли нерасторопного, вялого человека. Но против этого говорит полное отсутствие фамилии в центральных русских областях. Если бы основа была славянской, мы бы видели гнездо однокоренных фамилий — Махлов, Махлин, — а их нет. Так что тюркское происхождение остаётся основным.

Интересная деталь: в фамилии сохранился архаичный вариант суффикса -ев вместо более типичного для тюркских заимствований -ов. Это часто случалось, когда исходное имя оканчивалось на мягкий согласный или шипящий (в русском восприятии — на «ш»). Так Махлушев оказался в компании фамилий вроде Алышев, Тугушев, Кутушев — все они образованы по одному принципу, но с разными корнями.