Фамилия Маланкина — женская форма, а её мужской вариант — Маланкин. В основе фамилии лежит нецерковное имя или прозвище Маланка, которое в русской традиции чаще всего связывают с уменьшительной формой канонического имени Мелания (от греческого «мелайна» — «чёрная», «тёмная»). В народном произношении имя Мелания превращалось в Маланья, отсюда и пошли Маланка, Маланя — так в быту называли девочек и женщин, особенно в крестьянской среде XIX века.

Словообразование здесь прозрачное: суффикс -ин указывает на принадлежность. Маланкин — буквально «сын или потомок Маланки». Такая модель типична для восточнославянских фамилий, особенно распространённых в центральных и южных губерниях России, где отчества и прозвища на -ин закрепились как фамилии ещё в XVII–XVIII веках.

Интересная деталь: прозвище Маланка могло относиться не только к имени. В южнорусских и украинских говорах «маланкой» называли также женщину, которая любит наряжаться, кокетку или, наоборот, неряху — в зависимости от контекста. Поэтому не исключено, что в отдельных случаях фамилия пошла не от крестильного имени, а от бытовой характеристики. Однако основная версия — от имени Мелания — надёжнее и подтверждается записями в переписных книгах, где имена Маланка и Маланья фиксировались как самостоятельные.

Фамилия Маланкина встречается преимущественно в Поволжье, на Среднем Урале и в Сибири — регионах, куда активно переселялись крестьяне из центральных областей в XIX веке. Среди носителей фамилии нет широко известных исторических фигур, что типично для фамилий, образованных от простонародных имён: предки Маланкиных — скорее всего, крепостные крестьяне или посадские люди, не оставившие заметного следа в документах, но сохранившие родовое имя в быту.