Фамилия Маканькина — женская форма, мужской вариант — Маканькин. В её основе лежит прозвище или нецерковное имя Маканя или Маканька, которое, скорее всего, образовано от имени Макар. Имя Макар (греч. Makarios — «блаженный», «счастливый») было на Руси распространённым, и от него охотно образовывали уменьшительные формы: Макаша, Маканя, Макарка. Суффикс -к- в прозвище Маканька указывает на ласкательное или обиходное обращение, а -ин в фамилии — на принадлежность: «чей?» — «сын Маканьки» или «дочь Маканьки».

Менее вероятная, но возможная версия связывает фамилию с диалектным словом «макать» (обмакивать, погружать в жидкость). В таком случае прозвище Маканя мог получить человек, занимавшийся маканием свечей или, скажем, любивший макать хлеб в квас. Однако версия с производным от имени Макар выглядит убедительнее: она укладывается в типичную модель русских фамилий, где суффикс -ин присоединяется к основам на -а/-я (ср. Маканин, Макашин, Макаров).

Фамилия Маканькина не относится к числу частых, её география не имеет ярко выраженного ареала — носители встречаются и в центральной России, и в Поволжье. Это говорит о том, что фамилия возникла в крестьянской или мещанской среде, где именование по отцу (патроним) свободно переходило в наследственную фамилию уже в XVII–XIX веках. Интересная деталь: в некоторых говорах «маканя» могло означать «мямля» или «неповоротливый человек», но это значение, скорее всего, вторичное и шуточное, а не исходное для прозвища.

Таким образом, Маканькина — это фамилия, которая прямо указывает на предка по имени Макар (или с прозвищем Маканя) и входит в обширный ряд русских фамилий на -ин, образованных от уменьшительных форм канонических имён.