Фамилия Маланцева — женская форма фамилии Маланцев, и её происхождение напрямую связано с мужским каноническим именем Малахия или его производными. В основе лежит, скорее всего, не само полное имя, а его обиходный, разговорный вариант — Малан, который был распространён в русской, украинской и белорусской среде. Полное имя Малахия (древнееврейского происхождения, означает «посланник Бога») в народе сокращали до Малан, Маланя, отсюда и пошли фамилии на -цев и -цов. Модель образования типична: суффикс -ев (в форме -цев) указывает на принадлежность — «сын Маланца» или «потомок Малана».

Стоит отметить, что в фамилии Маланцева есть редкая деталь: она образована не через стандартный суффикс -ов, а через -цев, что характерно для имён, оканчивающихся на -ан, -ян, -ей. Такая модель чаще встречается в северных и центральных регионах России, а также в среде староверов, где сохранялись архаичные формы словообразования. Если бы основа звучала как «Малан», то фамилия была бы Маланов, но суффикс -цев подсказывает, что исходным прозвищем или именем было «Малан» с мягким окончанием, которое в родительном падеже давало «Маланца».

Географически фамилия Маланцева не является массовой. Она встречается в Вологодской, Архангельской областях, а также в Сибири, куда переселенцы принесли свои фамилии в XVII–XIX веках. Носители фамилии могли быть крестьянами или посадскими людьми, но не стоит исключать и связь с церковной средой: имя Малахия носил один из библейских пророков, поэтому в духовных семьях такое имя давали детям, и фамилия могла закрепиться за потомками священников или дьячков.

В словаре Б. Унбегауна «Русские фамилии» модель на -цев разбирается как одна из продуктивных для имён, заканчивающихся на -ей (например, Андрей — Андрейцев), но для Малана она менее типична, что делает фамилию Маланцева более локальной и менее подверженной массовым изменениям. Споров о происхождении почти нет: версия с именем Малахия — основная, а попытки связать её с тюркским «мал» (скот) или с глаголом «малать» (пачкать) выглядят натянутыми и не подтверждаются ономастической традицией.