Фамилия Мальчуковские образована от прозвища Мальчук. Это уменьшительная форма от прилагательного «малый», и в старых крестьянских семьях так нередко называли самого младшего из сыновей. Прозвище могло закрепиться и за невысоким человеком, либо за тем, кто сохранял юношескую внешность. В основе фамилии — мирское имя, которое давали в быту до повсеместного распространения церковных календарей.

Главная особенность фамилии — суффикс -овск(ий). Это типично польский или западнорусский (шляхетский) способ образования фамилий. В отличие от простых русских фамилий на -ов (Мальчуков), форма на -овский указывает на дворянское или шляхетское происхождение предка. Мальчуковские — это потомки того самого Мальчука, которые, вероятно, принадлежали к мелкопоместной шляхте или служилому сословию на землях современной Украины, Беларуси или восточных окраин Речи Посполитой. Именно там фамилии на -ский были распространены шире всего.

Слово «мальчук» в старых говорах могло иметь и переносное значение — «молодой парень», «подросток». В польском языке «malec» означает «малыш», что подтверждает общеславянские корни прозвища. Таким образом, фамилия одновременно указывает и на возраст, и на рост, и на социальную роль в семье.

О точном времени появления фамилии Мальчуковские судить трудно: процесс закрепления фамилий у шляхты шёл с XV по XVII век, и окончательно они оформились к концу XVIII века. Сама фамилия — редкий пример, где славянское прозвище «облагородили» аристократическим суффиксом.