Фамилия Малоногий — редкий случай, когда прозвище, лёгшее в основу, почти не требует расшифровки. Это прямое указание на физическую особенность: человек с короткими ногами. В русской традиции такие прозвища давали без злого умысла, просто как меткую бытовую примету, по которой человека знали в деревне. Малоногий, Кривоногий, Сухорукий — все они из одного ряда: описательные прозвища, которые закрепились за родом.

Словообразовательная модель здесь архаичная. Фамилия образована по типу прилагательного с суффиксом -ий, что характерно для древнейшего пласта русских фамилий — так называемых «качественных» или «прозвищных» фамилий. В отличие от массовых фамилий на -ов/-ев (Малоногов), форма Малоногий сохранила полное окончание прилагательного. Такие фамилии чаще встречались на юге России и в Украине, где притяжательные формы на -ий были распространены шире, чем в северных говорах. В документах XVII–XVIII веков можно найти запись «казак Малоногий» — это указывает на возможную связь с вольными поселениями, где личное прозвище легче переходило в фамилию.

Интересно, что фамилия почти не дала ответвлений. Вариант Малоногов встречается, но он явно вторичен — его могли искусственно «обрусить», добавив стандартный суффикс при переписи, когда писарь переделывал необычную форму на привычный лад. Но и Малоногов, и Малоногий — это одна и та же история про человека, которого в глаза называли коротконогим.

Социальный контекст прост: фамилия крестьянская или казачья. Дворянских родов с такой фамилией не зафиксировано — слишком откровенное прозвище для гербовой знати. В переписных книгах XVII века похожие прозвища встречаются у посадских людей и крестьян центральных и южных уездов. Если ваш предок носил фамилию Малоногий, скорее всего, он жил в Черноземье или на Слобожанщине, где такие прозвища бытовали особенно долго.