Фамилия Малонос — редкий случай, когда прозвище почти полностью сохранилось в неизменном виде, минуя стадию типичных фамильных суффиксов. В её основе лежит устойчивое сочетание «мало нос» — так на Руси могли назвать человека с маленьким носом, курносого или с приплюснутой переносицей. Подобные «физиогномические» прозвища были широко распространены: Нос, Носатый, Долгонос, Кривонос. Малонос — их прямая противоположность, образованная по той же модели, что и, скажем, Малорослый или Малозуб.

Словообразовательный анализ показывает: фамилия не получила патронимического суффикса (-ов, -ин), что для русских фамилий нехарактерно. Обычно прозвище Малонос давало бы Малоносов или Малоносин. Сохранение чистой основы — признак того, что фамилия могла закрепиться в форме прозвища и лишь позднее, при переписях, была записана как есть. Такое встречается в северных и сибирских говорах, где фамилии нередко фиксировали в «сыром» виде, без искусственной русификации.

Версия о происхождении от украинского или белорусского «малоносий» (малоносый) менее вероятна: в этих языках прилагательное обычно переходило в фамилию с окончанием -ий (Малоносий), а не в виде краткой формы. Скорее всего, фамилия великорусская, возникшая в среде, где прозвища были однословными и не требовали суффиксального оформления.

По социальному составу — вероятно, крестьянская или посадская. Дворянские роды с такой фамилией в истории не зафиксированы. Встречается фамилия спорадически, без выраженного гнезда в одном регионе, что говорит о её первичной «прозвищной» природе: каждый Малонос — потомок конкретного человека, получившего меткое уличное имя, а не целого рода, разошедшегося из одного села.