Фамилия Малоокие (а также её форма в единственном числе — Малоокий) — это прозвищная фамилия, типичная для украинской ономастики. В её основе лежит прозвище Малоокий, которое давали человеку с маленькими глазами. Это прямое указание на внешность: слово «малоокий» составлено из корней «мало-» и «-ок-» (от «око»). Интересно, что прозвища с корнем «глаз» встречались чаще, а форма с «оком» тяготела к книжной, более торжественной или ироничной речи. Возможно, прозвище подчёркивало не просто размер глаз, а их выразительность или, наоборот, невзрачность.

Фамилия образована по продуктивной модели: прозвище на -ий перешло в фамилию без дополнительных суффиксов (как, например, у фамилий Белоус, Черноус). Окончание -ие в форме множественного числа (Малоокие) указывает на принадлежность целому роду или семье, что характерно для восточнославянских фамилий, особенно в среде казачества и крестьянства. В документах фамилия могла фиксироваться и как Малоокий, и как Малоокие — в зависимости от контекста: об одном человеке или о всей семье.

Точное время возникновения фамилии установить сложно: процесс закрепления прозвищ в качестве наследственных имён на Украине шёл с XV по XVIII век. Однако можно предположить, что фамилия Малоокие сформировалась не позднее XVII века, когда на Левобережной Украине, в среде реестрового казачества, активно складывались родовые прозвища, описывающие внешность. Среди однокоренных фамилий — Малооков, Малоочко, Малооченко, но форма Малоокие (Малоокий) стоит особняком: она сохранила архаичное окончание прилагательного, что делает её заметным памятником славянского словообразования.