Фамилия Малямин — довольно редкая, и её происхождение не лежит на поверхности. Вопреки первому впечатлению, она вряд ли связана с малярным ремеслом. Слово «маляр» пришло в русский язык из немецкого (Maler) и закрепилось в профессиональной среде довольно поздно, а фамилии от него образовывались бы с суффиксом -ов или -ев: Маляров, Малярев. Суффикс -ин в фамилии Малямин указывает на другой тип основы — скорее всего, на личное имя или прозвище, образованное от уменьшительной формы.

Наиболее вероятная версия ведёт к каноническому имени Емельян (от греческого «приветливый»). В народной речи это имя сокращалось до Маля, Малямка или Маляня. Форма Маляма — ласкательное производное, от которого с помощью притяжательного суффикса -ин и возникла фамилия. То есть Малямин буквально означал «сын Малямы» или «человек из рода Малямы». Такая модель типична для русских фамилий: Емельянов — от полной формы, а Малямин — от её разговорного варианта.

Есть и вторая, менее распространённая гипотеза. В некоторых южнорусских и украинских говорах «маляма» или «малямить» могло означать медлительного, вялого человека, того, кто «мается» или тянет время. В этом случае фамилия закрепилась бы за носителем такого прозвища по характеру. Однако эта версия слабее, так как не подкреплена устойчивой диалектной лексикой в словарях.

Географически фамилия Малямин встречается разрозненно, но заметный след оставила в старых переписях Вологодской и Костромской губерний. Там, на Русском Севере, долго сохранялись архаичные формы имён и прозвищ, которые в центральных областях уже вышли из обихода. Это косвенно подтверждает связь с именем Емельян: северные говоры часто «съедали» начало слова, превращая Емельяна в Меляна или Маляна.

С точки зрения словообразования фамилия стоит в одном ряду с такими же редкими вариантами, как Кузякин (от Кузя — Кузьма), Тимохин (от Тимоха — Тимофей) или Дёмин (от Дёма — Демьян). Все они образованы не от полного крестильного имени, а от его обиходной, «домашней» формы. Поэтому предок Малямин мог быть обычным крестьянином или ремесленником, которого в деревне звали просто Малямой — и это имя закрепилось за его потомками как фамилия.