Фамилия Малюченков — отличный пример того, как суффикс может рассказать о происхождении больше, чем корень. Перед нами модель на -енков, которая почти всегда указывает на сокращение от полной отчества с суффиксом -енко. Если на Украине и в Белоруссии фамилии на -енко остались в исходной форме (Малюченко), то в великорусских говорах их нередко «обрусели», добавив сверху -ов. Так Малюченко превратился в Малюченкова.

Корень — Малюч- или Малюк-. Это уменьшительное от имени Малафей или Малахия (в бытовой речи — Маланя, Малюта) либо от имени Мал, которое в древнерусской традиции давали не по росту, а как охранительное имя: считалось, что если назвать ребёнка «малым», злые силы его не заметят. Вторая версия, более прозаическая, — прозвище Малюк или Малюта, то есть «маленький человек», «коротышка». В говорах слово «малюта» и сейчас означает «малыш», «кроха».

Суффикс -енк- в украинской традиции — типичный показатель ласкательности или принадлежности (чей? — Малюченков, то есть сын Малюченка). В русской адаптации фамилия почти полностью потеряла уменьшительный оттенок и стала просто родовым именем. Географически фамилия тяготеет к южнорусским областям (Курская, Белгородская, Воронежская губернии) и к Слобожанщине — зоне, где украинское население веками соседствовало с русским, а фамилии на -енко охотно «наращивали» -ов для вписывания в официальный документооборот Российской империи.

Интересно, что в некоторых переписях XIX века встречается вариант Малюченков без «ё» — Малюченков, что могло привести к путанице с однокоренной фамилией Малюченков, образованной от имени Малюта (уменьшительное от Малюты, то есть «маленький»). Но ударение в исходной форме, скорее всего, падало на второй слог: Малючéнков, что отличает её от фамилий с суффиксом -ов от полных имён (например, Малюков). Носители этой фамилии — потомки человека, которого в документах записали как Малюченко, а позже «обкатали» по русскому образцу.