Фамилия Малюшко — характерный пример украинской модели фамилии на -ко, которая в XVII–XVIII веках активно вытесняла более ранние прозвища и патронимы. Суффикс -ко в украинской ономастике выполнял роль уменьшительности и принадлежности, часто указывая на «сына» или «младшего» носителя основы. В случае Малюшко основа — Малюш, что является производной формой от имени Малафей или Малах (просторечное Малашка), но с равной вероятностью — от прилагательного малый, то есть «небольшой», «младший». В украинских говорах слово малюк означает «ребёнок», «малыш», и прозвище Малюш мог получить самый младший в семье или человек невысокого роста.

Географически фамилия Малюшко тяготеет к западным и центральным областям Украины: чаще всего она встречается в Волынской, Ровенской, Житомирской и Хмельницкой областях. В России, особенно в южных регионах и на Кубани, Малюшко — результат переселений украинских крестьян в XIX веке. В Беларуси фамилия редка, но фиксируется на юго-западе, в зоне украинского языкового влияния.

Интересная деталь: в отличие от распространённых фамилий на -енко (Малющенко), форма Малюшко с суффиксом -ко без дополнительного -ен- считается более архаичной. Она могла возникнуть напрямую от прозвища Малюш, минуя стадию отчества. В реестрах казаков XVII века встречаются прозвища Малюта, Малюшка, но сам вариант Малюшко в письменных источниках появляется позже, в основном в метрических книгах XVIII — начала XIX века. Социально фамилия не была дворянской: её носители — преимущественно казаки, мещане и крестьяне.