Фамилия Мамотькина — женская форма фамилии Мамотькин, и её происхождение упирается в прозвище или имя Мамотька. Основа здесь — «мамоть», и это слово в русских говорах могло звучать по-разному. В словаре Владимира Даля «мамоть» — это «мямля», «рохля», то есть человек медлительный, нерасторопный или излишне мягкотелый. Прозвище давали по характеру: того, кто «мамотит» — тянет, мешкает, говорит невнятно. Фамилия образована по типичной модели с суффиксом -к- (уменьшительно-пренебрежительным) и далее — стандартным русским -ин. Суффикс -ин указывает на принадлежность: «чей?» — Мамотькин, то есть сын или потомок Мамотьки.

Интересно, что в некоторых говорах «мамоть» могло быть и ласковым обращением к матери (от «мама»), но для фамилии эта версия слабее: прозвища от «мамки» обычно образовывались иначе — Мамкин, Мамочкин. А вот «мамоть» в значении «неповоротливый человек» — корень более надёжный. Встречаются и однокоренные фамилии: Мамотин, Мамот, Мамотенко. Они различаются суффиксами и ареалом: Мамотькина — скорее из северных или центральных областей России, где -ть- в основе сохранялось, а на юге чаще звучало бы «Мамоткин» с твёрдым «т».

Географически фамилия редкая. По данным современных телефонных справочников и баз ЗАГС, носители Мамотькиных встречаются в Тверской, Псковской и Вологодской областях — то есть там, где дольше держались старые говоры. Это косвенно подтверждает, что прозвище возникло в крестьянской среде, где меткое слово легко прилипало к человеку. Социальный статус предков, скорее всего, был крестьянским или мещанским: дворянские фамилии так не образовывали.

Особенность написания — двойной суффикс: -оть- и -к-. Это не редкость для русских фамилий (сравните Бородькин, Молодькин), но указывает на то, что прозвище было не от имени, а от нарицательного слова с экспрессивной окраской. В документах XIX века могли писать и через «а» — Маматькин, но это диалектное колебание. Споров о происхождении почти нет: этимология прозрачна, и альтернативные версии (например, от тюркского «мамат» — «связанный») натянуты и не подтверждаются ареалом бытования фамилии.