Фамилия Маначинов — редкий пример, где основа ясна, а суффикс необычен. Корень здесь — «манач-», который восходит к тюркскому слову «мана» (верблюд). В тюркских языках так называли одногорбого верблюда-дромадера, а в переносном смысле — крупного, сильного или упрямого человека. Прозвище Манач могли дать либо за внешнее сходство (высокий, с крупной головой), либо за характер — несговорчивый, но выносливый. В русских говорах слово «манач» встречалось редко, чаще в южных и восточных регионах, где контакт с тюркскими народами был плотным.

Но самое интересное — суффикс «-инов». Обычно русские фамилии образуются с помощью «-ов» (Маначов) или «-ев» (Маначев). Вариант «-инов» встречается в двух случаях: либо от имени или прозвища на -иня (например, Маначиня — женская форма прозвища, от которой пошла фамилия сына: «чей? — Маначинин»), либо как результат переоформления. Второй вариант правдоподобнее: сначала существовала фамилия Маначин (от прозвища Манача), а позже, по аналогии с другими фамилиями на «-инов» (типа Минин — Мининов), её переделали в Маначинов. Такая путаница часто происходила в XIX веке при записи в церковных книгах.

Географически фамилия тяготеет к Поволжью и Приуралью, где тюркские влияния сильны. Встречается в Татарстане, Башкортостане, Оренбургской области. Сословно предки, скорее всего, были государственными или ясачными крестьянами — не дворяне, не казаки, а люди, платившие подати и занимавшиеся земледелием или скотоводством. Верблюдов в тех краях не разводили, но прозвище могло прийти с торговыми путями.

Сравните с однокоренными: Манаков (от «манак» — уменьшительное), Манаев (от «манай» — «мой верблюд»). Маначинов стоит особняком — редкая модель, указывающая на нестандартное прозвище и последующее искажение при документировании. Если ваша фамилия именно так пишется, с большой вероятностью предки жили на стыке русской и тюркской культур, а сама фамилия — результат живой народной этимологии, а не канцелярской правильности.