Фамилия Мангибаева — редкий пример, где форма на -ева не скрывает привычного отчества, а указывает на географическое или этническое происхождение. Её основа — Мангибай — тюркское составное имя, которое разбирается на две части: «манги» (вариант «менги», «мәңгі») — «вечный» и «бай» — «богатый, господин». В буквальном переводе Мангибай означает «вечно богатый» или «обладающий вечным богатством». Такие имена были распространены у казахов, ногайцев, башкир и других тюркских народов: родители желали сыну долгой и обеспеченной жизни, вкладывая в имя пожелание-оберег.

Суффикс -ева указывает на женскую форму фамилии. Мужской вариант — Мангибаев — образован по русской патронимической модели, но не от отчества, а от личного имени Мангибай. Это типично для тюркских фамилий, которые в XIX–XX веках адаптировали к русскому делопроизводству: к основе добавляли -ов/-ев, и фамилия начинала склоняться как обычная русская. Женская форма Мангибаева закрепилась в паспортах и документах, хотя по происхождению она не «принадлежащая Мангибаю», а «из рода Мангибая».

Фамилия почти не встречается в центральной России. Её ареал — Казахстан, Оренбургская, Астраханская области, отчасти Башкортостан. Там, где в XIX веке кочевали или оседали казахские роды, имена с корнем «манги» фиксировались в метрических книгах и ревизских сказках. Поскольку имя Мангибай не было распространённым, фамилия осталась локальной и немногочисленной.

Если сравнивать с однокоренными, то Мангибаева стоит в одном ряду с Мангитовыми (от «мангит» — название племени у ногайцев) и Мангушевыми (от имени Мангуш). Но в отличие от них, основа Мангибай прямо указывает на личное имя, а не на этноним. Это значит, что первый носитель фамилии — конкретный человек по имени Мангибай, а не его предок-родоначальник целого рода.

Встречаются варианты написания Мангибаева через «е» (Менгибаева) — они отражают диалектное произношение, где «а» переходит в «е» под влиянием мягкого «н». В документах начала XX века можно найти обе формы, но современная орфография закрепила вариант с «а».