Фамилия Мангутова образована от мужского личного имени Мангут. В основе этого имени лежит этноним «мангут» — так называлось монгольское и кыпчакское племя. Согласно монгольским этногоническим преданиям, племя мангут входило в древнемонгольскую фратрию нирун. Его родоначальником считали Мангудая — потомка праматери Алан-гоа в шестом поколении (по другой версии, Джаксу из седьмого колена от Алан-гоа). В конце XII — начале XIII века один из предводителей мангутов, Хуилдар-сэчэн, был побратимом Чингисхана и командовал его передовыми отрядами.

Поскольку имя Мангут — тюрко-монгольское по происхождению, фамилия Мангутова чаще всего встречается у народов, исторически связанных с кочевым миром и Золотой Ордой: у татар, башкир, казахов. Русская фамилия Мангутова, скорее всего, имеет тюркские корни и появилась в результате контактов с ордынской знатью или переселения татарских родов на русские земли после распада Орды.

Суффикс -ов в фамилии указывает на русскую модель образования: от отчества или прозвища отца. То есть Мангутовы — потомки человека по прозвищу или имени Мангут. Среди однокоренных фамилий — Мангушев, Мангулов, Мангуткин, но Мангутова стоит особняком из-за прямой связи с конкретным племенным именем, зафиксированным в средневековых источниках.

Фамилия Мангутовых — не просто указание на предка, а отсылка к целому пласту степной истории, где личное имя совпадало с названием рода. Поэтому, в отличие от многих русских фамилий на -ов, образованных от крестильных имён или прозвищ по профессии, эта фамилия напрямую выводит к этнической группе, сыгравшей заметную роль в эпоху монгольских завоеваний.