Фамилия Манисова — женская форма, но в основе её лежит мужская фамилия Манисов, а та, в свою очередь, образована от имени или прозвища Манис. Ключ к разгадке — в суффиксе. Здесь работает стандартная модель: на базе личного имени Манис (или прозвища) добавили патронимический суффикс -ов, получив «сын Маниса», а затем уже и фамилию.

Самая вероятная версия происхождения основы — от канонического имени Емельян в его народной, усечённой форме. Полное имя Емельян (от греческого «аймилиос» — ласковый) в русском быту давало множество производных: Емеля, Ема, Мана, Манис. Здесь сработала типичная для русской ономастики редукция начального гласного и упрощение, когда «Емеля» превратилось в «Маню», «Манюшу», а прозвищное «Манис» могло закрепиться за человеком медлительным, вдумчивым или, наоборот, льстивым — в зависимости от контекста.

Менее распространённая, но возможная версия — тюркское происхождение. В татарском и башкирском языках есть слово «манис» (или «мәнис») со значением «приятный», «милый», «обходительный». Если предок носителя фамилии жил в Поволжье или на Урале, где плотно пересекались русские и тюркские миры, такое прозвище могло прижиться. Спорность этой гипотезы в том, что фамилия с суффиксом -ов — чисто русский патроним, который редко накладывали на тюркскую основу напрямую, но в зонах смешанного населения это случалось.

Географически фамилия Манисова встречается нечасто, но прослеживается в центральных областях России и в Поволжье. В дореволюционных переписях Манисовых можно встретить среди крестьян и мещан — сословных групп, где прозвища часто переходили в фамилии без изменений. Дворянских родов с такой фамилией не зафиксировано, что указывает на её «низовое» происхождение.

Таким образом, Манисовы — это потомки человека, которого в деревне звали либо Емельяном (в ласковой форме), либо ласковым прозвищем из тюркского. Первая версия надёжнее и подтверждается массовой практикой образования русских фамилий от уменьшительных форм крестильных имён.