Фамилия Маногаров — одна из тех, где основа не бросается в глаза, а суффикс подсказывает, что перед нами типичная русская патронимическая модель на -ов. Но если присмотреться к корню, начинаются вопросы. В русском языке нет общеупотребительного слова «маногар». Значит, либо это искажённая форма, либо прозвище, либо заимствование.

Наиболее вероятная версия связывает фамилию с украинским или южнорусским диалектным словом «маногар» — так в некоторых регионах называли вид курительной трубки или, реже, самого курильщика. Прозвище Маногар мог получить человек, который постоянно курил трубку, либо тот, кто их изготавливал. В пользу этой гипотезы говорит и география: фамилия встречается в южных областях России, на Кубани и в Ростовской области, где такие диалектизмы были в ходу. Суффикс -ов указывает на принадлежность: «сын Маногара».

Есть и другая, менее очевидная версия: фамилия могла возникнуть от тюркского имени или прозвища. В тюркских языках «мана» означает «значение», «смысл», а «гар» — суффикс деятеля. То есть Маногар — «тот, кто обладает смыслом», «знающий». Но эта гипотеза слабее, так как не объясняет, почему фамилия закрепилась именно в русской среде с типичным славянским суффиксом. Скорее всего, тюркский корень был переосмыслен местным населением и привязан к бытовому прозвищу.

Фамилия редкая, в списках дворянских родов не значится. Судя по всему, Маногаровы — потомки крестьян или казаков, получивших фамилию по прозвищу предка. Встречаются единичные записи в метрических книгах XIX века по Воронежской и Екатеринославской губерниям. Написание устойчивое, вариантов вроде Маногор или Манагаров почти не фиксируется.