Фамилия Манукянц указывает на армянские корни, и ключ к ее происхождению — суффикс -янц. Это один из характерных патронимических суффиксов армянского языка, который означает «из рода» или «потомок». Если более привычный для слуха суффикс -ян (например, Манукян) буквально переводится как «род Манука», то форма на -янц исторически передавала принадлежность к конкретному роду или клану и часто встречается в фамилиях, сформировавшихся на западе исторической Армении, либо у носителей, эмигрировавших в Российскую империю через Крым и южные губернии.

В основе фамилии лежит личное имя Манук. Это имя имеет древние корни и в переводе с армянского означает «мудрый». В армянской ономастике имя Манук считается уменьшительно-ласкательной формой от имени Мануэл (библейское Эммануил — «с нами Бог»), но со временем за ним закрепилось и самостоятельное значение, связанное с мудростью и разумом. Так что фамилия Манукянц буквально означает «потомок Манука», а в более широком смысле — «потомок мудрого человека».

Интересно, что фамилии на -янц в русском языке часто подвергались адаптации: в документах и бытовом общении окончание могли записывать как -янц, -янс или даже -янцев (по аналогии с русскими фамилиями на -ов). Форма Манукянц — одна из тех, что сохранила армянское звучание почти без изменений. Носители этой фамилии в Российской империи в основном принадлежали к купеческому сословию или духовенству, так как именно эти слои активнее фиксировали родовые имена в письменных источниках.