Фамилия Манущева — женская форма фамилии Манущев. Её основа почти наверняка восходит к крестильному имени Мануил (каноническая форма — Еммануил, в народном произношении Мануил, Мануйло). Это древнееврейское имя означает «с нами Бог». В русской традиции имя Мануил не было редким, особенно в среде духовенства и купечества, но чаще встречалось в простонародной форме Мануйла.

Модель образования типична для русского Северо-Запада и Поволжья. Суффикс -ев указывает на принадлежность: Манущев — буквально «сын Мануща». А вот форма «Манущ» (а не «Мануйло» или «Мануил») — это нестандартный, усечённый вариант. Скорее всего, в основе лежало прозвище или обиходное имя Мануща, образованное от того же Мануила через характерное для русских говоров смягчение и усечение (ср. Павел → Павша, Иван → Иваш). Звук «щ» вместо «ш» (Мануща вместо Мануша) может указывать на севернорусское или владимирское произношение, где «щ» произносилось твёрдо и долго.

Версия о тюркском происхождении фамилии (от арабского «манус» — «полезный, благотворный») менее правдоподобна, так как суффикс -ев в русских фамилиях почти всегда славянский патронимический, а не заимствованный. Если бы основа была тюркской, фамилия скорее имела бы форму Манусов или Манусов.

Таким образом, носительница фамилии Манущева может считать своим предком человека по имени или прозвищу Мануща — вероятно, крещёного Мануила, жившего на русском Севере или в Вятском крае. Фамилия не относится к числу дворянских или аристократических: в массе своей такие фамилии носили крестьяне, мещане и церковнослужители.