Фамилия Манзенков образована по стандартной для русских фамилий модели: к основе на -н- добавляется суффикс -ов. То есть сначала возникла фамилия Манзенков, где Манзен — усечённая форма от Манзеня или Манзенка, а уже она в свою очередь произошла от прозвища или имени Манза. Суффикс -енк- в основе указывает на украинское или южнорусское происхождение прозвища: в малороссийских говорах -енко означало «маленький», «сын такого-то», ср. Манзенко — «сын Манзы». На севере и в центральной России такой суффикс при адаптации фамилии часто заменяли на -енков, что мы и видим.

Корень «манз-» неочевиден и вызывает споры. Самая вероятная версия связывает его с диалектным словом «манза» — так в некоторых говорах называли медлительного, неповоротливого человека, а также ленивого или сонного. В словаре В. И. Даля «манзить» означает «мешкать, копаться, делать вяло». Прозвище Манза могли дать медлительному или флегматичному парню. Менее вероятная, но допустимая гипотеза — связь с тюркскими языками: в казахском и киргизском «манз» означает «знак, метка», а в переносном смысле — «отличительный признак». Однако для русской фамилии такая этимология менее типична, и большинство ономастов склоняются к славянскому корню.

Географически фамилия Манзенков встречается преимущественно в южных и центральных областях России, особенно заметна в Воронежской, Курской и Ростовской областях. Это косвенно подтверждает южнорусский или украинский след в основе. Встречаются варианты написания Манзенко (без суффикса -ов), которые типичны для украинской ономастики. Носители фамилии Манзенков в XIX веке относились к крестьянскому сословию, реже — к мещанскому; дворянских родов с такой фамилией не зафиксировано.

Таким образом, предок современных Манзенков, скорее всего, получил прозвище Манза за неспешность или лень, а его сын стал Манзенком, а затем, при переходе в великорусскую среду, фамилия обросла окончанием -ов. Фамилия редкая, не массовая, но её структура прозрачна и не требует натяжек.