Фамилия Манзенюк с первого взгляда кажется загадочной, но её разгадка лежит в украинской или белорусской модели словообразования. Суффикс -юк указывает на происхождение с запада Украины или юго-запада Беларуси: в этих краях так обозначали сына или потомка человека. Основа — Манзен — скорее всего, производное от имени или прозвища Манза.

Самое правдоподобное объяснение корня — через уменьшительную форму имени Мануил (церковное Еммануил, в народе — Мануйло). В украинских говорах Манза или Манзя — это ласковое обращение к человеку с таким именем, вроде «Манюня». Тогда Манзенюк — «сын Манзы» или «потомок Мануила». Вторая версия, менее вероятная, от слова «манзен» как диалектного варианта «манжета» (обшлаг рукава) — но это дало бы прозвище портному или щёголю, что редкость для фамилии с таким суффиксом.

Написание с «е» во втором слоге (Манзенюк, а не Манзинюк) указывает на возможное влияние польского языка или на то, что исходное прозвище звучало как Манзен. В польской ономастике встречается фамилия Manzen, и суффикс -uk/-iuk — частый способ адаптации польских основ в украинских землях. Так что предки носителя этой фамилии могли быть крестьянами или мещанами из Волынской, Подольской или Гродненской губерний, где подобные «патронимы» на -юк были нормой.

Фамилия редкая, в отличие от массовых Мануйловых или Мануиловых, которые распространены по всей России. Манзенюк — локальный вариант, сохранивший более архаичную форму личного имени. Встретить её можно в основном в Ровенской, Житомирской и Брестской областях, а также среди потомков переселенцев в Сибири и на Дальнем Востоке.