Фамилия Мараховський (в русской передаче — Мараховский) звучит как типичная польская или украинская фамилия с суффиксом -ский. Этот суффикс указывал на дворянское происхождение или принадлежность к определённой местности. Чаще всего такие фамилии образовывались от названия населённого пункта: владелец поместья или выходец из села Марахово, Мараховка или Марахув. Точное место найти сложно, но топонимы с корнем «марах» встречаются на территории современной Польши и Западной Украины, особенно в бывших Галиции и Волыни.

Основа фамилии — прозвище или имя Марах. Это может быть производное от канонического имени Марк (через народные формы Марко, Марах) или от глагола «марать» в значении «пачкать», «чернить». В старину Марахом могли прозвать человека неопрятного или, наоборот, того, кто работал с красками, сажей — например, маляра или трубочиста. Вторая версия менее вероятна для фамилии на -ский, так как этот суффикс чаще крепился к географическим названиям, а не к прозвищам.

С точки зрения словообразования фамилия идёт по модели «Марах + -ов + -ский». Суффикс -ов- здесь выполняет роль притяжательного элемента, связывая основу с местом: «принадлежащий Мараху» или «из поселения Марахово». Такая конструкция типична для польской шляхты, которая часто брала фамилии по названию родового имения.

Встречается фамилия и в украинском, и в польском вариантах написания: Мараховський, Мараховский, Marachowski. В России носители фамилии — это в основном потомки переселенцев с запада, либо люди, чьи предки получили фамилию при унификации документов в XIX веке, когда польские и малороссийские фамилии записывали на русский лад. Сословно это могли быть как мелкопоместные дворяне, так и крестьяне, взявшие фамилию по названию деревни, откуда их приписали к помещику.

Споров вокруг происхождения немного: основная версия — топонимическая. Единственная альтернатива — еврейское происхождение, так как суффикс -ский встречается и в ашкеназских фамилиях, но для Мараховского это маловероятно: корень не характерен для идиша, а фамилия не фиксируется в списках типично еврейских.