Фамилия Марходей — редкая и неочевидная для русского уха. В ней нет привычных суффиксов -ов, -ин или -ский, что сразу выдаёт нерусское происхождение. Скорее всего, перед нами пример фамилии, принесённой в Россию переселенцами или сформировавшейся на окраинах империи под влиянием местных языков.

Наиболее вероятная версия — молдавское или румынское происхождение. В румынском языке слово «marhod» или «marhodei» не является общеупотребительным, но может восходить к диалектному прозвищу. Корень «marh» (сравните с цыганским «мархо» — «еда, хлеб») или «марх» в значении «товар, имущество» (от венгерского «marha» — «скот, имущество») позволяет предположить, что прозвище Марходей могли дать торговцу скотом, зажиточному крестьянину или человеку, чья профессия была связана с перегоном и продажей скота. Суффикс -ей в румынских фамилиях часто указывает на принадлежность или происхождение: «сын такого-то» или «человек, связанный с тем-то».

Вторая, менее правдоподобная версия — связь с украинским или белорусским диалектным словом «мархотка» (ценная вещь, богатство). В этом случае фамилия могла закрепиться за бережливым хозяином. Однако фонетически «Марходей» ближе к молдавскому ареалу.

Географически фамилия встречается в Молдове, в Приднестровье и среди потомков переселенцев из Бессарабии. В дореволюционных списках она почти не фигурирует, что говорит о её позднем закреплении в письменных источниках — скорее всего, в XIX веке, когда крестьянам массово давали фамилии по прозвищам.

Словообразовательная модель проста: основа «Марход» + суффикс -ей. В русском языке такая конструкция нехарактерна, поэтому фамилию часто коверкали при переписи, записывая как «Марходеев» или «Марходьев», но исходная форма сохранилась именно в таком виде у носителей. Споров о корне немного: все версии сходятся на том, что в основе лежит понятие, связанное с имуществом или скотом, а не с личным именем.