Фамилия Маркотин — один из тех случаев, когда на слух кажется, что перед нами типичная «профессиональная» фамилия вроде Маркитантова (от маркитанта — торговца при армии), но на деле корень здесь совсем другой. Разберёмся по порядку.

В основе фамилии лежит не имя, не ремесло, а прозвище или уменьшительная форма имени. Модель образования простая: суффикс -ин указывает на принадлежность («чей?» — Маркотин). Значит, предка звали Маркота. А это, скорее всего, производное от канонического имени Марк (от латинского Marcus — «молоток»). В народной речи имя Марк легко обрастало суффиксами: Марко, Маркуша, Маркота. Так что Маркотин — буквально «сын Маркоты», то есть потомок человека, которого в быту звали уменьшительно-ласкательным Маркота.

Вторая, менее вероятная, но возможная версия — от прозвища. В некоторых говорах «маркотный» означало «вялый, сонный, скучный». Если прозвище Маркота получил человек медлительный или меланхоличный, фамилия пошла бы от этой черты характера. Однако такая связь менее надёжна: суффикс -ота в прозвищах встречается редко, а вот как окончание уменьшительного имени — вполне обычно.

Географически фамилия Маркотин тяготеет к южнорусским и центральным областям — Курской, Воронежской, Тамбовской губерниям. Встречается она нечасто, и это говорит о том, что родоначальник был, скорее всего, крестьянином или однодворцем, а фамилия закрепилась в одном-двух сёлах, а не разошлась широко по стране. Есть и редкий вариант написания с «а» — Маркотин, но он ни на что не влияет: основа та же.

Интересно, что фамилия Маркотин стоит в ряду однокоренных, но более редких: Маркотов, Маркотин, Маркотьев. Все они восходят к одному корню Марк-, но различаются суффиксами, которые в XVI–XVII веках местные писцы «пришивали» к прозвищу по своему усмотрению. Поэтому, если вы встретите Маркотова, это не другая фамилия, а её «двоюродный брат» — с другим патронимическим суффиксом.