Фамилия Марковин — редкий случай, когда в основе лежит не христианское имя, а мирское прозвище Морковь. В древней Руси такие «овощные» имена давали не в насмешку, а как оберег: считалось, что имя, связанное с чем-то обыденным и земным, отведет от ребенка внимание злых сил. Со временем прозвище превратилось в фамилию, но в произношении закрепился акающий вариант — Марковин, хотя в некоторых говорах до сих пор встречается форма Морковин.

Суффикс -ин указывает на принадлежность: Марковин буквально значит «сын Маркова» или «человек из рода Маркова». Однако сам Марков — это уже отчество от того же прозвища Морковь. Получается цепочка: человека звали Морковь, его сына записывали как Марков (с аканьем), а внук уже стал Марковиным. Такая двойная патронимическая модель встречается реже, чем простые фамилии на -ов, и говорит о том, что фамилия сформировалась не в центральных, а скорее в северных или восточных регионах России, где суффикс -ин был особенно распространен.

В ономастических справочниках фамилия Марковин обычно не выделяется в отдельную статью, ее рассматривают в гнезде с фамилией Морковин. Унбегаун в своем труде «Русские фамилии» упоминает подобные случаи, когда нецерковное имя становилось основой для фамилии, минуя стадию крестильного имени. Это важный штрих: Марковины, скорее всего, происходят из крестьянской или посадской среды, где мирские имена держались дольше, чем в дворянских родах.

Географически фамилия тяготеет к бассейну Волги и Вятке. В переписных книгах XVII века встречаются отдельные упоминания крестьян Морковиных в Арзамасском уезде и Марковиных в Саратовском Поволжье. В современной России фамилия остается малочисленной, что делает ее особенно ценной для генеалогического поиска — найти однофамильцев проще, а значит, есть шанс восстановить родословную до конкретного предка, носившего имя Морковь.