Основой фамилии Марковин послужило мирское имя Морковь. Фамилия Марковин образована от нецерковного имени Морковь (замена гласного «о» на «а» объясняется влиянием «акающих» говоров). Таким образом, потомок человека, обладающего именем Морковь, со временем получил фамилию Марковин.