Фамилия Марохотина — женская форма от фамилии Марохотин, и в её основе лежит мужское личное или мирское имя Марохота. У этого имени есть как минимум две версии происхождения, и обе по-своему интересны.

Первая версия связывает имя Марохота с диалектным словом «мороха». Владимир Даль в своём словаре определяет «мороху» как «морось, ситовник, мельчайший дождь». Если следовать этой логике, Марохотой могли назвать ребёнка, родившегося в сырую, дождливую погоду. Такие «погодные» имена были в ходу у славян: они не были редкостью и служили своего рода оберегом или просто приметой, запоминающейся окружающим.

Вторая версия выводит Марохоту из производной формы мужского крестильного имени Марон. Имя Марон имеет сирийские корни и переводится как «Господь наш». В русской традиции иностранные имена часто сокращали и переделывали на свой лад, так что появление уменьшительной формы Марохота от Марона вполне вероятно. В этом случае фамилия восходит не к прозвищу, а к каноническому церковному имени.

С точки зрения словообразования, фамилия Марохотин (и Марохотина) образована по стандартной русской модели: к основе имени Марохота добавился притяжательный суффикс -ин. Фамилии на -ин обычно указывали на принадлежность конкретному человеку: «чей?» — Марохотин, то есть сын или потомок Марохоты.

Какая из двух версий правдоподобнее? Обе имеют право на существование, но первая — «дождевая» — встречается в ономастических словарях чаще. Имена-прозвища от явлений природы (Ветров, Дождев, Морозов) были широко распространены, и «мороха» как мелкий дождь давала яркую и запоминающуюся характеристику. Версия с именем Марон слабее, потому что сама форма Марохота для него не совсем типична: обычно от Марона образовывали Маронов или Марошин.

Фамилия Марохотина встречается в основном в центральных и южных регионах России, но массовой или частой её не назвать. Это редкая фамилия, что делает её особенно ценной для семейной истории: чем реже фамилия, тем проще проследить её корни по документам.