Фамилия Мархотина — женская форма фамилии Мархотин, и её разбор стоит начать с суффикса. В русской ономастике суффикс -ин указывает на принадлежность: Мархотин буквально значит «сын Мархоты» или «человек из семьи Мархоты». То есть в основе лежит личное прозвище или неканоническое имя Мархота.

Сам корень «Марх-» — тёмный и редкий. У него нет очевидного славянского значения, и здесь открывается поле для версий. Первая и самая вероятная: это вариант имени Марк, Марко. В некоторых русских говорах и украинских диалектах «Марко» могло перейти в «Мархота» через добавление экспрессивного суффикса -хот- (как в именах Михота от Михаил, Стехота от Степан). Такие формы были характерны для простонародной, неофициальной среды: крестьяне и ремесленники часто переделывали церковные имена на свой лад. Если это так, то предок носителя фамилии был крещёным человеком по имени Марк, которого в быту звали Мархотой.

Но есть и менее очевидная версия. В южнорусских и белорусских говорах слово «мархотка» могло означать что-то мелкое, нежное или ласковое (ср. «марха» — кроха, малютка). В этом случае прозвище Мархота дали бы либо маленькому ребёнку, либо человеку невысокого роста или хрупкого телосложения. Однако эта гипотеза слабее: слово плохо фиксируется в письменных источниках, и его значение восстанавливается предположительно.

Географически фамилия Мархотин (и Мархотина) тяготеет к центральным и южным областям России, но не является массовой. Встречается в документах Воронежской, Тамбовской, Рязанской губерний, а также среди казачества. Это указывает на крестьянское или мещанское происхождение — дворянских родов с такой фамилией не зафиксировано. Сословный состав, как видим, скромный: предки, скорее всего, были государственными или помещичьими крестьянами, возможно, однодворцами.

Интересная деталь: в старых переписях фамилия могла писаться через «о» — Мархотин, но встречается и вариант «Мархоткин» (с другим суффиксом), что подтверждает ту же основу. Если ваш предок носил фамилию Мархотина, то перед вами — редкий случай, когда фамилия сохранила не просто имя, а его народную, «домашнюю» форму, почти не попавшую в официальные святцы.