Фамилия Мархотко образована от прозвища Мархотка, в основе которого лежит аналогичное украинское диалектное слово. В переводе оно означает «махорка». Так называют однолетнее травянистое растение, род табака. Вполне вероятно, что прозвище Мархотка относится к так называемым «профессиональным» именованиям, содержащим указание на род деятельности человека: возможно, предок современного носителя фамилии Мархотко был торговцем табаком. Следует отметить, что фамилия Мархотко распространена на территории Белоруссии. Так и прозвище Мархотка закрепилось за человеком в качестве наиболее употребительного именования, а со временем легло в основу фамилии Мархотко. При образовании славянских фамилий использовались различные форманты: суффиксы принадлежности (-ов/-ев, -ин, -ский/-цкий), уменьшительные суффиксы (-онок/-ёнок, -енко, -ко, -ец, -ек, -ик, -чик, -еня, -о), суффиксы отчества (-ович/-евич, -ич) и др. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Мархотка, со временем получил фамилию Мархотко.