Фамилия Махотко звучит необычно для русского уха, и это не случайно. Её происхождение, скорее всего, украинское или белорусское, на что указывает характерный суффикс -к(о). В восточнославянской ономастике этот суффикс типичен для украинских фамилий (например, Шевченко, Бондаренко) и реже встречается в белорусских. Он не указывает на принадлежность роду, как русские -ов/-ев, а скорее фиксирует прозвище или профессию в уменьшительной или ласкательной форме.

Основа фамилии — «Махот» — вызывает вопросы. Самый прямой путь ведет к украинскому слову «махотка» или «макітра»: так называют глиняный горшок, макитру. В таком случае прозвище Махотко мог получить гончар, либо человек, которого в шутку сравнивали с пузатым горшком за полноту или крепкое телосложение. Это объяснение простое и правдоподобное, оно опирается на бытовую лексику, из которой часто вырастали фамилии.

Есть и менее очевидная версия: связь с глаголом «махати» (махать). Тогда Махотко — человек, который чем-то размахивает, возможно, косарь или мельник. Но эта гипотеза слабее, так как глагольные основы в украинских фамилиях с суффиксом -к(о) встречаются реже, чем предметные.

Фамилия редкая и географически локализована. Поиск по открытым данным показывает, что носители Махотко встречаются в основном на западе Украины, в частности в Хмельницкой и Винницкой областях, а также среди украинской диаспоры. В России она почти не распространена, что подтверждает её четкое региональное происхождение.

Таким образом, предок современного Махотко, скорее всего, жил на территории современной Украины и получил прозвище по ремеслу (гончар) или по внешней черте. В XIX веке, при массовом закреплении фамилий, это прозвище и стало родовым именем.