Фамилия Махотенко — яркий пример украинской модели фамилии с суффиксом -енко. В украинской ономастике этот суффикс исторически означал «сын» или «потомок», то есть Махотенко буквально — «сын Махоты». Вопрос в том, кем был тот самый Махота.

Скорее всего, Махота — это производная форма от крестильного имени Матфей (в народном произношении — Махтей, Махотка). Такое стяжение и переделка имён — обычное дело: Матвей превращался в Махвея, а от него — в Махоту. Уменьшительно-ласкательный суффикс -от- придавал имени оттенок просторечия, фамильярности, что характерно для семейного или уличного прозвища. Менее вероятна, но возможна связь с диалектным глаголом «махать»: в некоторых говорах «махота» — это тот, кто размашисто работает, суетится или даже хвастается.

Географически фамилия тяготеет к центральным и восточным областям Украины: Черкасской, Полтавской, Харьковской. Оттуда в XIX–XX веках Махотенко вместе с волнами миграции попали на Кубань, Дон и в Сибирь. Встречается и вариант Махотенко с ударением на второй слог, что не меняет сути.

В сословном плане носители фамилии были в основном крестьянами и казаками. Украинский суффикс -енко в XVII–XVIII веках широко бытовал среди казацкой старшины и мещан, но массово закрепился именно в сельской среде. Какого-то яркого «дворянского следа» у Махотенко нет — это фамилия простого человека, чей предок носил бытовое прозвище по имени или по черте характера.