Фамилия Махотины образована от личного прозвища Махота — так в старину могли ласково называть ребенка. Если исходить из этой версии, то фамилия Махотин — это буквально «сын Махоты», то есть потомок человека, носившего такое прозвище. Подобная модель с суффиксом -ин типична для русских фамилий, образованных от слов, оканчивающихся на -а: она отвечает на вопрос «чей?» и закреплялась за детьми и домочадцами.

Прозвище Махота, в свою очередь, скорее всего, связано с диалектным словом «махота» — так в некоторых говорах называли небольшой горшок или кринку. Вряд ли ребенка прозвали в честь посуды напрямую, но в народной речи такое слово могло использоваться как шутливое или уменьшительно-ласкательное обращение к малышу — например, за круглощекосгь или приземистую фигуру. Возможно и другое прочтение: в ряде регионов глагол «махать» давал производные вроде «махота» в значении «непоседа», «тот, кто машет руками». Обе трактовки сходятся к тому, что прозвище носило бытовой, неофициальный характер и закреплялось за конкретным человеком по внешности или поведению.

Точное место и время возникновения фамилии Махотин назвать сложно: процесс формирования русских фамилий растянулся на несколько столетий, и в разных регионах он шел с разной скоростью. Массово фамилии у крестьян и посадских людей закрепились лишь к XVII–XVIII векам, хотя отдельные прозвищные именования встречаются в документах и раньше. Поэтому можно лишь утверждать, что фамилия Махотин относится к распространенному типу русских фамилий, возникших от прозвищ, и что ее носители, вероятно, происходят из центральной России или Поволжья, где диалектное слово «махота» было в ходу.

Интересно, что фамилия не имеет никакого отношения к церковным именам — в ее основе лежит чисто народное, обиходное слово. Это делает ее ценным свидетельством живой разговорной речи прошлого. Родственные фамилии — Махоткин, Махотенко, Махотюк — встречаются у русских, украинцев и белорусов, что подтверждает широкое бытование прозвища в разных славянских говорах. Сама фамилия Махотин, таким образом, представляет собой памятник славянской письменности и культуры, сохранивший в застывшей форме то, как наши предки называли друг друга в повседневной жизни.