Фамилия Марохотин — из числа тех, где за привычным звучанием скрывается неочевидный корень, и разобраться в нём помогает не столько морфология, сколько диалектная лексика и народные имена. Суффикс -ин указывает на принадлежность: Марохотин — «чей?» — сын или потомок человека по прозвищу или имени Марохота.

Самый надёжный путь к значению — через слово «мороха», которое Владимир Даль в своём словаре объясняет как «морось, ситовник, мельчайший дождь». Отсюда мирское имя Марохота: так в русской деревне могли назвать ребёнка, родившегося в затяжную дождливую погоду. Имена по погоде и времени рождения — распространённая древнерусская традиция, и Марохота в этом ряду стоит рядом с Вешняком, Морозом или Студенём.

Вторая версия менее вероятна, но тоже имеет право на существование: Марохота как производная форма от канонического имени Марон (сирийское «Господь наш»). Однако в пользу первого объяснения говорит и акающее произношение (Марохота из «мороха», а не из «Марон»), и то, что фамилия бытует в регионах, где диалектное слово «мороха» было в ходу.

Так или иначе, в основе фамилии лежит личное именование, а не прозвище по ремеслу или внешности. Марохотины — потомки человека, которого в своё время отличали не по занятию, а по обстоятельству рождения или по имени, данному при крещении. Фамилия редкая, с прозрачной внутренней формой, но без громкой истории — из тех, что хранят память о бытовой, непарадной стороне жизни предков.