Фамилия Марохина образована от мужского имени или прозвища Мароха. Вопрос лишь в том, что стояло за этим словом изначально — погодное явление или религиозное имя.

Первая и самая прямая версия отсылает к диалектному слову «мороха». В «Толковом словаре живого великорусского языка» Владимира Даля «мороха» — это морось, мельчайший дождь, ситовник. Если следовать этой логике, мирское имя Мароха могли дать младенцу, появившемуся на свет в дождливую, пасмурную погоду. Такие «погодные» имена (вроде Ветр, Снежан, Дождь) были распространены в русской деревне до введения обязательных церковных имен — они служили оберегом или просто отражали обстоятельства рождения.

Вторая гипотеза связывает Мароху с церковным именем Марон. Марон — имя сирийского происхождения, означающее «Господь наш» (от сирийского «мар» — господин). В просторечии оно могло сократиться и адаптироваться в уменьшительную форму Мароха. Такое стяжение типично для русской народной традиции: полное имя укорачивали до двух-трёх слогов, добавляя суффикс -ох- (-ех-), как в именах Михей → Михоха, Антип → Антоха.

Фамилия Марохина закрепилась в форме притяжательного прилагательного с суффиксом -ин: Марохин — «чей?» — сын Марохи. Женская форма Марохина указывает на принадлежность к роду Марохиных. Суффикс -ин типичен для фамилий, образованных от основ на -а/-я, и широко распространён в северных и центральных областях России.

Какая из версий правдоподобнее? Обе имеют право на существование, но первая — с «морохой» — выглядит более народной и объясняет необычное звучание фамилии без привлечения церковного календаря. Имя Марон в святцах есть, но его уменьшительная форма Мароха встречается редко, тогда как прозвища от погодных явлений — явление частое. Впрочем, без конкретных исторических записей по региону бытования фамилии окончательный выбор сделать трудно.

География фамилии Марохина сегодня не привязана к одной местности: её носители встречаются и в центральной России, и в Поволжье, и на Урале. Это говорит о том, что фамилия не узко локальная, а возникла независимо в разных местах — что тоже косвенно поддерживает версию с прозвищем, ведь дождь идёт везде.