Фамилия Марокко звучит для русского уха экзотично, но на деле это не географическая отсылка к африканской стране, а коренная русская фамилия, образованная от прозвища. В основе лежит слово «морок» — в древнерусском языке оно означало «обман, наваждение, мрак, туман». Человека могли прозвать Мороком за хмурый нрав, склонность к хитрости или за то, что он «морочил голову» окружающим. В диалектах также встречается значение «сумрак, темнота», так что прозвище могло пристать к угрюмому или нелюдимому человеку.

Фамилия оформлена по продуктивной модели с суффиксом -к(о), который характерен для украинской и южнорусской ономастики. Суффикс -к(о) часто придавал фамилии оттенок принадлежности или уменьшительности. В данном случае он мог закрепиться в формах типа Морокко, а затем, под влиянием акающего произношения (безударное «о» звучит как «а»), превратился в Марокко. Такое фонетическое искажение — обычное дело для фамилий, записанных со слуха в документах XVIII–XIX веков.

Встречается фамилия в основном на юге России и в Украине, особенно в бывших казачьих областях. В реестрах Войска Запорожского XVII века упоминаются казаки с прозвищем Морок, что подтверждает древность корня. Встречаются и однокоренные фамилии: Мороков, Морокин, Морочко. Марокко — более редкий вариант, сохранивший архаичную форму прозвища и необычное окончание.

Связь с государством Марокко случайна и возникла из-за графического совпадения. Никакого отношения к маврам или африканским землям фамилия не имеет. Единственное, что могло повлиять на её закрепление — это народная этимология: в XIX веке грамотные писаря могли «подправить» неблагозвучное Морокко на более благородное Марокко, ассоциируя его с заморской страной. Но основа осталась чисто славянской, от слова «морок».