Фамилия Марушнева — женская форма фамилии Марушнев, и её разбор стоит начать с суффикса, который сразу выдаёт не самый частый способ образования. Мужской вариант Марушнев заканчивается на -ев, но основа здесь не на -ов, а на -нев. Такое окончание характерно для фамилий, образованных от прозвищ или имён, оканчивающихся на -ня или -нь. В данном случае корень «Маруш-» почти наверняка восходит к уменьшительной форме имени Мария — Маря, Маруша. В русских говорах и в быту XVI–XVII веков имя Мария давало целый веер производных: Маря, Марюша, Маруня, Маруха, Маруша. Форма Маруша — ласкательная, она могла принадлежать как женщине, так и, реже, мужчине (в качестве домашнего имени, например, для Марка или Мартына).

Модель образования проста: к основе «Маруш» добавили суффикс -нев. Этот суффикс встречается реже, чем обычный -ов, но он закономерен: если исходное слово оканчивалось на мягкий согласный или на -ня, то притяжательное прилагательное образовывали с помощью -ев, а в некоторых диалектах — с -нев (ср. фамилии Сорокин, но Зимин — от Зима, и Марушнев — от Марушня). Скорее всего, прозвище или имя было именно Марушня (как вариант Маруша), и от него пошла фамилия: «чей?» — Марушнев, то есть сын или потомок Марушни.

Географически фамилия Марушнева (и Марушнев) тяготеет к северо-западу России и к бывшим новгородским землям. В псковских и тверских говорах слово «маруша» могло означать не только уменьшительное от Марии, но и «маруха» — женщина лёгкого поведения (впрочем, эта версия менее вероятна для основы фамилии: фамилии от таких прозвищ редки и обычно имеют иную суффиксацию). Более надёжная версия — от имени Маруша, которое было распространено в крестьянской среде как нецерковное, бытовое.

Сравнение с однокоренными фамилиями помогает уточнить картину. Есть фамилии Марушев, Марушин, Марухин — все они от того же корня, но с разными суффиксами. Марушнев стоит особняком из-за суффикса -нев, что указывает на диалектное произношение или на конкретную форму прозвища (Марушня, а не Маруша). Если бы исходной была форма Маруша, фамилия звучала бы как Марушев. А Марушнев — это «сын Марушни», где -ня — характерный для северных говоров суффикс, придающий имени оттенок принадлежности или ласкательности.

Таким образом, носительница фамилии Марушнева может считать, что её предки по мужской линии происходили из среды, где имя Марушня (или Маруша) было личным, возможно, женским, но фамилию закрепили по отцу или деду, которого в быту звали Марушней. Сословно это, скорее всего, крестьяне или посадские люди — дворянские фамилии с таким суффиксом не зафиксированы. Фамилия редкая, нечастотная, и её форма — хороший маркер локальной северной или северо-западной традиции имяобразования.